ジョイスティックのABCDボタンにコマンドを設定できないのはなぜですか？

可能です。A/B/C/Dキーをテーマキーとして設定する場合は、まず現在A/B/C/Dキーを使用しているテーマのテーマキーを別のキーに変更してから、「コマンド設定」ページに戻り、A/B/C/Dキーを設定する必要があります。